연구/논문에 도움되는 툴들

출처: 김박사넷 - 초심자들을 위한 논문 쓰는 팁, 개인적으로 쓰고 있는 연구에 도움되는 몇 가지 툴들

● 서지 프로그램

1. 엔드노트:  참고문헌 작성 & 논문정리

가. Import

• 다운받은 논문(PDF) 정리: File -> Import -> File 또는 Folder -> Import file에 이미 다운받은 PDF 또는 폴더 선택 -> Import option: PDF 선택 후 OK => 가지고 있는 논문의 서지사항을 (절반 이상의 확률로) 자동으로 넣어줍니다. 
• 서지사항 다운: 각 저널의 사이트에서 “Download citation”, “Export” 등의 버튼을 찾아서 RIS 또는 Endnote 형식의 파일을 다운로드 후 EndNote에서 Import 함 (Import Option 지정 필요) 
  
  • IEEE Xplore Digital Library에서 사용방법
    - IEEE Xplore에서 검색 후 서지저장할 논문 체크
    - 상단 'Export'-'Citations'-'Format: RIS, Include: Citation & Abstract' 선택후 'Export' 클릭
    - EndNote에서 'File-Import'에서 'Import Option: RIS' 지정 후 저장된 *.ris 파일을 Import

• 서지사항 자동 PDF 다운로드: 서지사항 우클릭 후 Find full text -> (유료 구독 논문 제외하고) 자동으로 PDF를 다운해서 서지사항에 연동시켜줍니다. 이건 생각이상으로 위대한... 기능입니다. 써보셔야 합니다.
• 서지사항 업데이트 (처음 online 버전으로 나오고, 추후 volume, issue, page가 정해질 때 사용하면 좋은 기능입니다): 서지사항 우클릭 후 Find reference update 클릭

나. 참고문헌 작성

• 투고할 저널에 맞춘 레퍼런스 스타일 변형: 투고 단계에서 레퍼런스 스타일을 저널에 맞게 바꿔야 할 때가 있습니다. Cell 스타일을 썼는데, 미묘하게 다른 경우가 있죠. 실험실 사람들에게 가장 많이 받는 요청 중에 하나입니다. "누구야, 이것 좀 어떻게 해줘...." 
  1) 스타일 다운로드: https://endnote.com/downloads/styles/
  2) 스타일 직접 미세조정: (예시: Cell 스타일에서 미세조정이 필요한 경우) 
  Tools -> Output style -> Edit "Cell" -> (새 창) -> 왼쪽 Bibilography -> Journal Article "Author (Year). Title. Journal Volume| (Part/Supplement)|, Pages|, Article Number|. DOI|." 여기서 미세조정 하시고 창을 닫으시면 스타일이 저장됩니다 -> 워드로 가셔서 서지사항 업데이트. 몇 번 시행착오를 겪으시면 어떻게 변경하시는지 아실 수 있을겁니다.
  - 저널 약자(abbreviation)
  제가 지금 겪고 있는 문제입니다. 무슨 일을 해도 저널이 약자로 안바뀝니다;;
  예: Mol Cell Proteomics 라고 쓰고 싶은데 Molecular & cellular proteomics : MCP 라고 뜹니다.
  1) 엔드노트 버전 9 이하를 쓰시는 분 참고
  https://support.clarivate.com/Endnote/s/article/EndNote-Generate-full-or-abbreviated-journal-names?language=en_US
  "Tools > Open Term Lists > Journal Terms List".
  2) 엔드노트 버전 20을 쓰시는 분 참고
  https://support.clarivate.com/Endnote/s/article/EndNote-20-Generate-full-or-abbreviated-journal-names?language=en_US
  "Library > Open Term Lists > Journal Terms List".
  링크된 사이트 하단에 Term lists.zip 다운 후 압축 해제
  Journal Terms List 연 후 List 탭 -> Import List -> (아까 압축 푼 폴더에서) BioScience 열기 -> 워드에서 레퍼런스 업데이트
  이러면 왠만하면 해결됩니다.
  그래도 해결이 안되면 아래와 같이 수동으로 해결하시면 됩니다.
  
  문제의 원인은 다음과 같습니다
  "Cell" 스타일은 Full journal name이 아니라 Abbreviation 1을 출력해서 보여줍니다.
  따라서 저는 Abbreviation 1을 고쳐야 합니다. 
  Journal Terms List 들어가시면 Full journal과 Abbreviation 1이 보이실 겁니다
  "Cell" 스타일은 Abbreviation 1을 보여주기 때문에 
  저는 Mol Cell Proteomics -> Edit term -> Abbreviation 1을 Mol Cell Proteomics 로 수정했습니다
  (엔드노트가 참 거시기한게 Full journal을 Cell Rep라고 저장해놓으면 abbreviation은 Cell reports 로 저장해놓습니다;; 아무리 서지사항의 edit를 눌러도 해결이 안되는 원인이죠. 저널 서지사항을 다 full journal name으로 해놓으시면 이 문제가 해결될 경우가 많으실 겁니다)
  
  본문 검색: 제가 이번 논문에 in silico라는 단어를 써보고 싶었습니다. 이 단어에 적합한 문장 구조나 호응하는 주어, 동사, 부사는 무엇인지 알고 싶었습니다. 이때 쓰는 기능이 본문 검색입니다. Advanced search -> PDF -> in silico 검색. 이렇게하면 가지고 있는 논문의 본문에서 in silico를 검색해 줍니다. 구글에서는 대부분 제목과 abstract까지만 찾아주는 데, 이를 극복할 수 있는 꿀팁이죠. 이를 잘 써먹기 위해서라도 엔드노트에 PDF로 논문을 잘 모아두세요. 큰 자산이 됩니다. 
  
  위의 기능만 잘 사용해도 엔드노트에서 논문 검색하고, 논문 읽고, 정리하실 수 있습니다. (지금 일일이 폴더 만들어서 논문 PDF 정리하고 계신분들은 반드시 엔드노트 쓰세요. 두 번 쓰세요)

EndNote-20-Guide_2110_UNIST.pdf

2.62MB

● 영작/문법

1. Grammarly: https://www.grammarly.com/

웹에서 파일을 올려서 교정이 가능하지만 무료회원의 경우 용량 제한이 있어, MS Word에 Add-on 하는 것을 추천함
무료버전 써도 기본적인 사항 더블체크한다고 생각해고 쓸 정도는 됨
Set Goal 설정: Audience-Expert, Formality-Formal, Domain-Academic, Tone-Analytical, Intent-Describe

2. Quillbot (Premium 부분 유료): https://quillbot.com/ 

AI 웹 기반 패러프래이징 영작 관련 보조 서비스. 썩 나쁘지 않은 문장 Rephrasing과 문법 검토 기능을 제공하는데, 제안하는 후보 문장을 이리저리 살펴보며 다양한 동의어와 Rephrasing 방식도 익힐 수 있음. 그러나 이런 종류의 서비스는 기계적인 부분도 많아서 반드시 오랜시간 사용해보고 결제를 판단하길 권장.

● Figure

1. PPT
- 파일 -> 옵션 -> 고급 -> 파일 이미지 압축 안함 체크 
- 디자인 -> 슬라이드 크기 -> 사용자 지정 -> 슬라이드 크기: A4 (세로). 
- Arial, 글씨크기 10 (데이터가 많으면 8, 더 많으면 7). 
- 쏠쏠한 단축키: Ctrl + Shift + 좌클릭 => 개체복사 기능인데 같은 자리에서 복사됩니다. 파워포인트 위에 쓴 label을 복사할 때 이보다 좋은 것은 없습니다 (써보시면 무슨 말인지 압니다). 
- 상하좌우 0.5 cm 정도 여백을 주면 그림을 보기가 더 편합니다. 18 cm x 24 cm 크기의 직사각형을 한가운데에 그려놓고 그 밖을 넘어가지 않게 데이터를 배치하시면 됩니다.

2. 포토스케이프: http://photoscape.co.kr/ps/main/download.php 
사진 데이터 (특히 웨스턴) 쓰시는 분들은 꼭 사용하세요. 두 번 쓰세요. 맨날 웨스턴 밴드가 기울어져 있으신 분들은 이 프로그램 쓰시고 신세계를 맛보신 후에, 저한테 절해주세요. 미리 감사합니다.

● Plot

1. Origin

2. 그래프패드: 
유료 프로그램이고, 비싸지만, 쓰시기를 권장합니다. 개인으로 구매하시든, 실험실에서 구매해서 같이 쓰시든 꼭 쓰세요. 직관적이고, 통계처리하기에 쉽고, 나중에 그래프 크기나 형태를 변형하실 때 매우 좋습니다. 저는 그래프패드 내에서 arial, 폰트크기 14, 세로 5 cm로 그래프를 제작한 후, PPT로 복사하고, 개체의 크기를 50%로 합니다. 그러면 PPT에서 arial, 폰트 크기 7로 일관적이게 쓸 수 있습니다. 

● Math

1. Mathpix (무료 기능만으로도 아무런 문제 없음)

수식 OCR 프로그램인데 단축키 지정한 이후로 Latex나 Word에서 손수 수식을 편집해볼 기회가 언제였는지 기억이 안 날 정도로 인식률이 좋고 편함. 태블릿 등에서 필기로 써서 처리해도 문제 X. 그냥 컴퓨터 화면에서 수식이 있는 부분을 한번 긁어주면 Latex equation, word export, 심지어 png 이미지 형태로까지 친절하게 몽땅 뽑아내준다.

● 표절

1. Turninit: 표절 검색 프로그램입니다. 

국문 논문에 카피킬러가 있다면, 영어 논문은 턴인잇이 있죠. 본인이 참고한 논문이 무엇인지 적나라... 하게 잘 알려줍니다. 표절을 정의하기는 어렵습니다만, 문제의 소지가 있다면 패러프레이징 하시길 권장드립니다. 유료입니다만 학교 도서관에서 아이디를 구매했을 확률이 꽤나 높습니다. 학교 도서관 홈페이지나 전화로 문의하셔서 사용이 가능한지 여부를 확인해보세요.